Vị trí đầu tiên tại khu vực nút giao v??i t??nh lộ 15 (huyện Củ Chi) đã lệch tim so với quy hoạch lớn nhất khoảng 80m, nên phải bố trí đư??ng cong đáp ứng tiêu chuẩn nhằm đảm bảo các yếu tố hình học theo tiêu chuẩn đư??ng ô tô cao tốc yêu cầu thiết kế. Vị trí tiếp theo tại khu vực tiếp giáp giữa huyện Bình Chánh (TPHCM) với huyện Bến Lức (Long An) đư??c ??iều chỉnh hướng tuyến lệch về phía Tây theo quy hoạch của tỉnh Long An nhằm đảm bảo hài hòa bình diện tuyến. Tại vị trí huyện Bình Chánh, khu vực ??iều chỉnh chủ yếu là đất nông nghiệp nên ảnh hưởng rất nhỏ đến người dân.

Trong quá trình thực hiện, đư??ng Vành đai 3 có một số điểm chưa hoàn toàn phù hợp với dự án và đồ án ??iều chỉnh quy hoạch chung xây dựng TPHCM đến năm 2025 nên phải ??iều chỉnh nhằm đảm bảo kết nối thông suốt và đảm bảo các yếu tố kỹ thuật. Việc thay đổi này vẫn phù hợp với mô hình, cấu trúc phát triển không gian và định hướng hạ tầng kỹ thuật khung của đồ án ??iều chỉnh quy hoạch.